JR北海道の函館本線は函館から長万部，小樽，札幌を経由して旭川に至る路線で，函館－新函館北斗間と小樽－旭川間が交流20kV 50Hzで電化されています．

　五稜郭変電所は道南いさりび鉄道　七重浜－五稜郭間に設置され，北海道新幹線との共用区間とのき電境界にある木古内き電区分所の異電圧交交セクションから五稜郭までと，函館本線の函館－新函館北斗間のき電を担当しています．変電所自体は函館本線の五稜郭－桔梗間の沿線にあり，そこから木古内方へのき電線が延びています．